مأموریت اصلی شاعا با عضویت آزمایشگاه مرکزی دانشگاه‌ها، شناسایی، شبکه سازی و به اشتراک گذاری تجهیزات، توانمندی‌ها و ظرفیت‌های سخت افزاری و نرم افزاری آزمایشگاه‌های تحقیقاتی کل کشور است، به نحوی که خدمات آنها در قالب شبکه های یکپارچة ملی، منطقهای و یا استانی، با کیفیت مناسب، درکوتاهترین زمان و با کمترین هزینة ممکن در دسترس اعضای هیأت علمی، محققان و متخصصان کشور قرارگیرد.